key: cord-0039043-9silgwnb
authors: Puel, J.; Bouguermouh, R.; Okacem, O.; Orillac, M.; Prere, M.F.; Lefevre-Witier, Ph.
title: La flore virale fécale au hoggar()
date: 2006-11-07
journal: Ann Inst Pasteur Virol
DOI: 10.1016/s0769-2617(82)80032-4
sha: 98a904714f8b3e11e684506c863e55662cdff610
doc_id: 39043
cord_uid: 9silgwnb

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Depuis plus de 10 ans, un certain hombre de travaux de biologie humaine se poursuivent au Sahara alg6rien grace ~ la collaboration du Centre National de la Recherche Scientifique fransais et de l'Off~ce National de Recherche Scientifique alg6rien. En 19fi9, nous avons pu montrer qu'en l'absence de route vaccination, les populations touaregs s'immunisaient contre les trois types de poliovirus d~s les premieres ann6es de la vie [1] . 21 nous a sembl6 int6ressant de poursuivre cette 6tude dans le cadre du projet de recherche franco-alg6rien ~ Biologie des Populations Sahariennes ~ initi~ en 1977, en 6tudiant syst6matiquement la flore virale f6cale au Hoggar dans le but de d6terminer d'une part le r61e jou6 par certains virus comme les rotavirus dans l'6tiologie des gastro-ent6rites aigues et, d'autre part, d'essayer de connaitre la diffusion des ent6rovirus dans cette r6gion.

Notre enqu~te concerne 235 prdl6vements de selles rdalis6s chez des habitants s6dentaires de Tamanrasset ou de villages de l'Atakor (partie centrale du Hoggar) ou chez des pasteurs semi-nomades dont la plupart sont venus du Mali se rdfugler la fronti6re sud de l'Alg6rie et m6me jusqu'aux faubourgs de Tamanrasset, certains de leurs enfants 6rant regroupds ~ l'Internat nomade de Tamanrasset.

Les pr616vements rdalisds en pots st6riles ont 6t6 conservds ~ 4 ~ C et trait6s d6s leur arriv6e ~ l'Institnt Pasteur d'Alg6rie et au Laboratoire de Microbiologie du CHU Purpan fi Toulouse. Deux types d'examens ont 6t6 effectu6s : examen direct en immuno61ectronmicroscopie, r6alis6 avec des 7-globulines polyvalentes, et inoculation en cultures de tissu (primocultures de rein de singe, cellules diploides WI-38 ou MRC5, ligndes continues), mais il n'a pas 6t6 possible d'effectuer les deux types d'examens sur toutes les selles. En avril 1978, en particulier, l'examen direct n'a 6t6 rdalis6 que sur les selles de nourrissons. 

Si la flore f~cale potentiellement responsable de gastro-entfirites aigu~s est pr~sente au Hoggar et au Sahel, elle apparait, au moins chez les pasteurs semi-nomades, peu responsable de syndromes ent~riques aigus. Cela rejoint les conclusions de Rowland ~ l'occasion de son enqu~te en Gambie [2] .

La fr~quence des rotavirus est tr~s in%rieure ~ eelle que nous avons relevfie en France [3] et ~ celle qui est relevfie habituellement dans les autres pays off elle est rarement in%rieure ~ 20 %, sauf au Guatemala (14 %) [4] ou au Manitoba (11%) [51. L'excr~tion des rotavirus dans les selles fitant variable selon les climats [6, 7] et le degr~ d'humidit~ [8], la faible incidence relev~e ici pourrait s'expliquer, soit par une variation saisonni~re puisque nous n'avons r~alis~ aucun pr~l~vement hivernal, soit paree que nous avons fait nos pr~l~vements en dehors des fipid~mies de diarrh~es, saul au eours de la derni~re mission. De plus, les conditions de pr~l~vement et de conservation ne sont pas exactement superposables ~ eelles reneontrfies en milieu hospitalier.

Par contre, nous avons ~t~ surpris par la frfiquence des coronavirus, comparable ~ celle observ~e par Schnagl en Australie [9] ; en mai 1980, comme dans le eas rapport~ par Caul en 1975 [10] , les prfil~vements ont ~t~ r~alisfis dans deux villages du Hoggar off de nombreux cas de gastro-ent~rites avaient ~t~ d~erits. Nous avons retrouv~ 1~ des partieules semblables aux coronavirus dans 5 selles sur 9 de sujets diarrh~iques et dans 8 selles sur 11 de sujets t~moins ; mais parmi ces derniers, l'interrogatoire --toujours difficile --n'a pas permis d'~carter avec certitude les sujets ayant pr~sent~ des troubles digestifs au cours des jours precedents.

M~me si le r61e pathog~ne des ent~rovirus dans les gastro-ent~rites aigu~s ne peut ~tre encore affirmS, on reste cependant surpris de lear fr~quence dans les selles des t~moins pasteurs semi-nomades touaregs, et de leur diffusion dans la zone g~ographique exp!or~e. En effet, dans cette Daira de Tamanrasset hyperaride, on observe une infestation virale comparable et parfois sup~rieure ~ celle de pays nettement plus humides [11, 12] .

Les associations virus-parasites doivent poser le probl~me de risques particu]iers aux jeunes enfants, bien qne nous manquions de donn~es sur l'~pid~miologie des gastro-ent~rites aigu~s du nourrisson au Hoggar. Dans cette zone saharienne, lieu de bouleversements ~conomiques et de brassage de populations, il semble essentiel, pour connaitre l'importance exacte de ces agents ~tiologiques et en particulier des rotavirus, d'instaurer un examen bact~rio-viro-parasitaire syst~matique, au moins dans tous les cas de gastro-ent~rites aigu~s du nourrisson.

KEY-WORDS: Rotavirus, Enterovirus, Adenovirus, Coronavirus, Hoggar; Gastro-enteritis, Man,

Notll). Presse todd