key: cord-0120770-6zjdqmny
authors: Goldstein, Edward
title: Detectability of the novel coronavirus (SARS-CoV-2) infection and rates of mortality from the novel coronavirus infection in different regions of the Russian Federation
date: 2020-09-07
journal: nan
DOI: nan
sha: 18640354749f2c47c7f1acd12fdf2ba4dd320040
doc_id: 120770
cord_uid: 6zjdqmny

Background: Laboratory diagnosis of the novel coronavirus (SARS-CoV-2) infection combined with tracing/quarantine for contacts of infected individuals affects the spread of SARS-CoV-2 and the levels of related mortality. Here, we examine the relation between detectability of SARS-CoV-2 infection (i.e. the proportion of detected COVID-19 cases among all cases of SARS-CoV-2 infection in the population) and levels of mortality from COVID-19 for the 85 regions of the Russian Federation. Methods: Lower case-fatality ratio (CFR, the proportion of deaths among all detected COVID-19 cases) corresponds to higher detectability of the SARS-COV-2 infection. We used data from the Russian Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human Wellbeing (Rospotrebnadzor) on the number of detected cases and the number of deaths from COVID-19 in the different regions of the Russian Federation to examine the correlation between case-fatality ratios and rates of mortality for COVID-19 in the 85 regions of the Russian Federation. Results: The correlation between case-fatality ratios and rates of mortality for COVID-19 per 100,000 on Sep. 17, 2020 in different regions of the Russian Federation is 0.68 (0.55,0.78). The region with both the highest COVID-19 mortality rate per 100,000 and the highest CFR (lowest detectability of SARS-CoV-2 infection) is the city of St. Petersburg. Conclusions: Detectability of SARS-CoV-2 infection is one of the factors that affects levels of mortality from COVID-19. Regions of the Russian Federation with relatively low detectability of SARS-CoV-2 infection (e.g. those regions for which case-fatality ratio is below the median value of 1.2% for the case-fatality ratio in different regions of the Russian Federation on Sep. 17, 2020 [3]) ought to increase testing for SARS-CoV-2 in order to mitigate the spread of SARS-CoV-2 and diminish the related mortality.

Вводная часть: Лабораторная диагностика новой коронавирусной инфекции в совокупности с отслеживанием/карантином для лиц, контактировавших с инфицированным лицом является эффективным способом для уменьшения распространения новой коронавирусной инфекции и снижения уровня соответствующей смертности. При этом, не все случаи заражения новой коронавирусной инфекцией в населении впоследствии выявляется (лабораторно диагностируются). Цель этой работы это оценка связи между выявляемостью новой коронавирусной инфекции (т.е. процентом выявленных случаев COVID-19 среди всех случаев заражения новой коронавирусной инфекцией в населении) и уровнем смертности от новой коронавирусной инфекции в разных субъектах Российской Федерации.

Методология: При более активном тестировании на новую коронавирусную инфекцию в населении, выявляемость новой коронавирусной инфекции увеличивается, а коэффициент летальности (процент смертельных случаев среди всех выявленных случаев новой коронавирусной инфекции в населении) уменьшается (т.к. при более активном тестировании, выявляются больше случаев заболевания COVID-19 в легкой и средней форме). Мы используем данные Роспотребнадзора о количестве выявленных случаев новой коронавирусной инфекции и количестве смертей от новой коронавирусной инфекции в разных субъектах Российской Федерации для того, чтобы оценить корреляцию между коэффициентом летальности и уровнем смертности от новой коронавирусной инфекции в разных субъектах Российской Федерации.

Результаты: Корреляция между коэффициентом летальности на 17/09/2020 и уровнем смертности от новой коронавирусной инфекции на 100,000 человек на 17/09/2020 в разных субъектах Российской Федерации равна 0.68 (0.55,0.78). Среди всех субъектов Российской Федерации, в г. Санкт-Петербурге самый высокий уровень смертности от COVID-19 на 100,000 человек и самый высокий коэффициент летальности (самая низкая выявляемость новой коронавирусной инфекции). Цель исследования: Оценка связи между выявляемостью (т.е. процентом выявленных случаев COVID-19 среди всех случаев заражения новой коронавирусной инфекцией в населении), коэффициентом летальности (процентом смертельных случаев среди всех выявленных случаев новой коронавирусной инфекции в населении) и уровнем смертности от новой коронавирусной инфекции на 100,000 человек в разных субъектах Российской Федерации.

Мы использовали данные Роспотребнадзора о количестве выявленных случаев новой коронавирусной инфекции и количестве смертей от новой коронавирусной инфекции в разных субъектах Российской Федерации на 17/09/2020 [3] . Мы также использовалили данные Росстата о численности населения в разных субъектах Российской Федерации на 1-го января, 2020 [4] в целях оценки уровня смертности от новой коронавирусной инфекции на 100,000 человек в разных субъектах Российской Федерации.

Мы оценили корреляцию между коэффициентом летальности (процентом смертельных случаев среди всех выявленных случаев новой коронавирусной инфекции в населении) и уровнем смертности от новой коронавирусной инфекции на 100,000 человек в разных субъектах Российской Федерации на 17/09/2020. Рис. 1: Коэффициенты летальности (процент смертельных случаев среди всех выявленных случаев новой коронавирусной инфекции в населении) и уровни смертности от новой коронавирусной инфекции на 100,000 человек в разных субъектах Российской Федерации на 17/09/2020.

Активное тестирование на новую коронавирусную инфекцию с последующих карантином для лиц, контактировавших с инфицированным лицом способствует уменьшению распространения новой коронавирусной инфекции [5] и снижению уровня соответствующей смертности. Высокий уровень тестирования на новую коронавирусную инфекцию наблюдается в ряде стран [1, 6] , включая Российскую Федерацию. Это приводит к высокому уровню выявляемости новой коронавирусной инфекции (т.е. проценту выявленных случаев COVID-19 среди всех случаев заражения новой коронавирусной инфекцией в населении) -так, в Исландии выявляемость новой коронавирусной инфекции оценена в 56% [1] . При этом, влияние выявляемости новой коронавирусной инфекции на уровень заболеваемости и смертности от новой коронавирусной инфекции в разных регионах Российской Федерации мало изучено. В этой работе, используя данные Роспотребнадзора о количестве выявленных случаев новой коронавирусной инфекции и количестве смертей от новой коронавирусной инфекции, мы установили высокую корреляцию между коэффициентом летальности (процентом смертельных случаев среди всех выявленных случаев новой коронавирусной инфекции в населении) и уровнем смертности от новой коронавирусной инфекции в разных субъектах Российской Федерации. Отметим также, что более низкий коэффициент летальности соответствует более высокой выявляемости новой коронавирусной инфекции. Соответственно, тестирование на новую коронавирусную инфекцию и выявляемость новой коронавирусной инфекции является одним из факторов, которые влияют на смертность от новой коронавирусной инфекции в России. В частности, более высокая выявляемость новой коронавирусной инфекции приводит к понижению уровня

смертности от новой коронавирусной инфекции. Наоборот, в субъектах Российской Федерации с относительной низкой выявляемостью новой коронавирусной инфекции --в частности, в ряде субъектов РФ (прежде всего, г. Санкт-Петербург), для которых коэффициент летальности для новой коронавирусной инфекции

Humoral Immune Response to SARS-CoV-2 in Iceland

Transmission of SARS-CoV-2 in Australian educational settings: a prospective cohort study

Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор)

Федеральная служба государственной статистики (Росстат)

World Health Organization. Contact tracing in the context of COVID-19

Contact Tracing during Coronavirus Disease Outbreak, South Korea