key: cord-0946128-i01yd6r2 authors: Pondaven-Letourmy, S; Alvin, F; Boumghit, Y; Simon, F title: Comment réaliser un prélèvement rhinopharyngé chez l’adulte et l’enfant en période de la pandémie de la maladie COVID-19 date: 2020-06-05 journal: nan DOI: 10.1016/j.aforl.2020.06.001 sha: 3fc27f6a6454f21f216a5fddf74caee7ecb363a6 doc_id: 946128 cord_uid: i01yd6r2 Abstract The nasopharyngeal swab is currently the main testing method used to diagnose COVID-19. The principle is to collect respiratory cells infected by the virus and to use the RT-PCR (Reverse Transcription - Polymerase Chain Reaction) technique to detect the RNA of the virus. The false negative rate is high, about 30%, which can mainly be explained by an incorrect execution of the technique may increase the false negative rate and decrease the test’s sensitivity. The aim of this note is to help healthcare providers to perform this test correctly in adults and children. Jusqu'à présent l'écouvillonnage rhinopharyngé était réalisé en routine pour diagnostiquer les infections respiratoires hautes d'origine virale, chez l'adulte et l'enfant mais généralement le test était pratiqué par des personnels soignants expérimentés, chez des patients symptomatiques hospitalisés. Actuellement, partout dans le monde, dans le contexte de pandémie à SARS-CoV-2, les stratégies de santé publique reposent sur le diagnostic précoce de patients symptomatiques, la détection des cas contacts et l'isolement des patients porteurs de la maladie COVID-19 afin de casser les chaînes de contamination et contenir l'épidémie. Dans ce contexte, l'analyse par PCR de prélèvement rhinopharyngé est réalisée massivement et la formation des équipes de préleveurs a souvent été succincte compte tenu de l'urgence et de l'échelle de la pandémie. Dans certains cas la formation a été limitée au visionnage de vidéos pédagogiques (sur Compte tenu des inconvénients de la méthode d'écouvillonnage rhinopharyngé (sa sensibilité, l'expérience désagréable pour le patient, le port nécessaire d'équipement personnel de protection par le préleveur) d'autres méthodes de prélèvements sont à l'étude. Une équipe de chercheurs de l'université de Yale aux USA a effectué des analyses RT-PCR sur des recueils de bains de bouche (à différencier du prélèvement oropharyngé ou amygdalien qui est moins efficace [4] ) effectués à domicile le matin à J o u r n a l P r e -p r o o f jeun par les patients. Cette méthode s'appuie sur la forte expression des récepteurs ACE2 en base de langue mise en évidence par l'étude de Xu et al [5] . Les résultats sont très encourageants avec une sensibilité au moins aussi bonne que pour les prélèvements rhinopharyngés, qui sont encore majoritairement utilisés aux Etats-Unis [6] . Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d'intérêts. How to Obtain a Nasopharyngeal Swab Specimen Safety management of nasopharyngeal specimen collection from suspected cases of coronavirus disease 2019 SARS-CoV-2 entry factors are highly expressed in nasal epithelial cells together with innate immune genes Comparison of nasopharyngeal and oropharyngeal swabs for SARS-CoV-2 detection in 353 patients received tests with both specimens simultaneously High expression of ACE2 receptor of 2019-nCoV on the epithelial cells of oral mucosa Saliva is more sensitive for SARS-CoV-2 detection in COVID-19 patients than nasopharyngeal swabs COVID-19 and ENT Pediatric otolaryngology during the COVID-19 pandemic. Guidelines of the French Association of Pediatric Otorhinolaryngology (AFOP) and French Society of Otorhinolaryngology (SFORL) Prolonged SARS-CoV-2 RNA Detection in Anal/Rectal Swabs and Stool Specimens in COVID-19 Patients After Negative Conversion in Nasopharyngeal RT-PCR Test An infant with a mild SARS-CoV-2 infection detected only by anal swabs: a case report Cluster of coronavirus disease 2019 (Covid-19) in the French Alps Spread of SARS-CoV-2 in the Icelandic Population